Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VCPP55072 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPP55072 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPP55072 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPP55072 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPP55072 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPP55072 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPP55072 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VCPP55072 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPP55072 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPP55072 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms