Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN3P54252 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN3P54252 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms