Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms