Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP11P51784 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP11P51784 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP11P51784 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP11P51784 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP11P51784 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP11P51784 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP11P51784 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP11P51784 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP11P51784 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP11P51784 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms