Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCR4P51679 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCR4P51679 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCR4P51679 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCR4P51679 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCR4P51679 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCR4P51679 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCR4P51679 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCR4P51679 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCR4P51679 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms