Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP4P49662 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP4P49662 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP4P49662 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP4P49662 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms