Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTPAP49638 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTPAP49638 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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