Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPFP49454 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPFP49454 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPFP49454 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPFP49454 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPFP49454 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPFP49454 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPFP49454 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPFP49454 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPFP49454 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPFP49454 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms