Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UTRNP46939 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UTRNP46939 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UTRNP46939 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
UTRNP46939 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UTRNP46939 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms