Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL21P46778 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL21P46778 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL21P46778 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL21P46778 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL21P46778 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL21P46778 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL21P46778 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms