Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP5P45974 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP5P45974 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP5P45974 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP5P45974 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP5P45974 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP5P45974 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP5P45974 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP5P45974 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP5P45974 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms