Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDH1P40925 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MDH1P40925 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MDH1P40925 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDH1P40925 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDH1P40925 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDH1P40925 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDH1P40925 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDH1P40925 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms