Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT2P35908 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT2P35908 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT2P35908 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms