Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM5P33992 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM5P33992 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
MCM5P33992 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM5P33992 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM5P33992 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM5P33992 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM5P33992 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM5P33992 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM5P33992 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM5P33992 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM5P33992 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM5P33992 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms