Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR5P32302 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms