Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA10P31260 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms