Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM5AP29375 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM5AP29375 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KDM5AP29375 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms