Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB2P29323 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms