Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms