Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms