Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTX3P26022 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTX3P26022 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTX3P26022 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTX3P26022 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms