Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMA3P25788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms