Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms