Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2B4P23634 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms