Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4BP23588 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms