Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRGP23470 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRGP23470 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRGP23470 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms