Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALB2P22676 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALB2P22676 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALB2P22676 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALB2P22676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CALB2P22676 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CALB2P22676 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CALB2P22676 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALB2P22676 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALB2P22676 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALB2P22676 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CALB2P22676 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALB2P22676 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms