Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGB6P18564 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGB6P18564 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms