Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB2P17787 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB2P17787 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms