Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRF1P14222 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRF1P14222 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRF1P14222 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRF1P14222 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRF1P14222 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms