Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms