Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMP1P11279 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMP1P11279 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms