Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2BP0DI82 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms