Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC166P0CW27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms