Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF888P0CJ79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF888P0CJ79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms