Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRGC1P0CF51 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms