Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CT47B1P0C2W7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms