Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF1RP07333 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF1RP07333 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms