Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKMP06732 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKMP06732 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKMP06732 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMP06732 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMP06732 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMP06732 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKMP06732 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKMP06732 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKMP06732 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMP06732 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMP06732 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMP06732 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMP06732 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKMP06732 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKMP06732 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKMP06732 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms