Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF4EP06730 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EIF4EP06730 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms