Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALCAP01258 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALCAP01258 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALCAP01258 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCAP01258 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCAP01258 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCAP01258 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCAP01258 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCAP01258 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms