Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F13A1P00488 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F13A1P00488 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F13A1P00488 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F13A1P00488 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F13A1P00488 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
F13A1P00488 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
F13A1P00488 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13A1P00488 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F13A1P00488 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F13A1P00488 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13A1P00488 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms