Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4FO95754 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4FO95754 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms