Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5LO95447 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5LO95447 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms