Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF6BO95407 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF6BO95407 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms