Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC6O95255 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC6O95255 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC6O95255 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms