Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPA1O75762 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPA1O75762 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms