Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLIN1O60240 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLIN1O60240 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLIN1O60240 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLIN1O60240 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLIN1O60240 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLIN1O60240 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLIN1O60240 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms