Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRC1O43663 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRC1O43663 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRC1O43663 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRC1O43663 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRC1O43663 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRC1O43663 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PRC1O43663 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms