Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2AO43633 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms